Yöntem, protein nanomakinelerinin ortaya çıkarılabilmesinin ve yeni hücre fonksiyonları mühendisliğinin geleceğini belirliyor.
Proteinler, laboratuar ortamında DNA moleküllerinin çift sarmal oluşturmak üzere fermuarla aynı şekilde birleşmesi için ortaya kondu. Gelişimi Washington Üniversitesi Tıp Fakültesi bilim insanları tarafından yürütülen yöntem, potansiyel olarak hastalığın teşhisine ve tedavisine yardımcı olabilecek, hücrelerin daha kesin bir şekilde mühendislik işlemine olanak tanıyan ve pek çok farklı görevleri yerine getirebilecek protein nanomakinelerinin tasarımına elverişli bir ortam yaratabilir.😃
Bokimya UW yüksek lisans öğrencisi olan Zibo Chen, "Herhangi bir makinenin çalışması için parçalarının tam olarak bir araya gelmesi gerekiyor." Dedi. “Bu yöntem, proteinleri tasarlamanızı mümkün kılıyor, böylece tam olarak istediğiniz gibi bir araya gelmesini sağlayabiliyorsunuz."
Araştırmacılar bulguları ve sonuçları Nature dergisinin 19 Aralık sayısında bildirmiştir.
Geçmişte, biyomoleküler nanomakinlerin tasarlanmasıyla ilgilenen Bilim insanları DNA'yı sıklıkla ana bileşen olarak ele aldılar. Bunun sebebi, DNA iplikçiklerinin bir araya gelip DNA'nın çift sarmalını oluşturmak için hidrojen bağları oluşturması kabuk edilir fakat sadece dizileri tamamlayıcı ise.
Ekip, aynı DNA dilini kullanarak birbirleriyle tam olarak eşleşen tamamlayıcı proteinler üreten yeni protein tasarım algoritmaları ortaya koydu.
Çalışmada araştırmacılar, Baker laboratuarında Rosetta adı verilen bir bilgisayar programı tercih ettiler. Program, bir amino asit zincirinin alacağı şeklin, zincirin amino asitleri ve zincirin içine daldırıldığı sıvı arasındaki çekim ve itme kuvvetleri tarafından yönlendirildiği gerçeğinden yola çıkar. Bu kuvvetleri en iyi dengeleyen şekli hesaplayarak, zincirin en düşük toplam enerji seviyesine ulaşması için program verilen bir amino asit zincirinin alacağı şekli tahmini de kolay olabilir.
Kayıtlar
Hiç yorum yok:
Yorum Gönder